- Mensajes ocultos en imágenes: En la etapa inicial se presentó a los participantes una imagen con un texto que invitaba a personas "inteligentes" a unirse a la "búsqueda". Tras analizar la imagen con programas especializados se descubrió texto oculto que indicaba la siguiente pista.
- Libro de runas: En una de las etapas los participantes se encontraron con un texto cifrado usando un antiguo alfabeto rúnico. Al descifrarlo, los jugadores hallaron un enlace a la siguiente prueba.
- Acertijos musicales: En algunos retos se emplearon composiciones musicales con pistas. Al analizar el espectrograma del archivo de audio, los participantes hallaban imágenes o textos ocultos.
- Coordenadas geográficas: Algunos rompecabezas contenían coordenadas geográficas que señalaban lugares en el mundo real. En esos lugares los jugadores encontraban códigos QR u otras pistas que conducían a la siguiente etapa.
- Referencias literarias: Cicada 3301 solía usar referencias a obras literarias clásicas, como "Ulises" de James Joyce o "Liber Primus", un libro misterioso que se supone fue escrito por los propios creadores de Cicada.
- Sitios web ocultos y protocolos: Las pruebas a veces conducían a sitios web ocultos accesibles solo a través de la red anónima Tor o utilizando protocolos especiales como Freenet.
Cada ronda de rompecabezas de Cicada 3301 se volvió más compleja y multicapa, obligando a los participantes a usar distintos métodos y herramientas para resolver los retos. Algunas pruebas incluyeron el uso de cifrados antiguos, astronomía, teoría del color e incluso religión.
Los rompecabezas de Cicada 3301 continuaron durante tres años, de 2012 a 2014, y cada ronda atrajo cada vez más participantes y espectadores que seguían la resolución del misterio y lo discutían en comunidades en línea. A pesar de que muchas pruebas fueron resueltas, el misterio de la propia organización y sus objetivos reales sigue sin aclararse.
Los rompecabezas de Cicada 3301 se convirtieron en un símbolo de desafío intelectual y misterio en Internet, continuando inspirando e interesando a aficionados de la criptografía, detectives y mentes curiosas de todo el mundo.